摘要 | 以桂花〔Osmanthus fragrans (Thunb.) Lour.〕品种‘早银桂’的总 DNA 为模板,对 SRAP - PCR 扩增体系中的模板 DNA 用量,Mg2 + 、 dNTPs 和引物浓度以及 Taq DNA 聚合酶用量进行单因子实验, 确立了适合桂花总 DNA 的SRAP - PCR 反应体系:反应体系总体积 10 μL,包括 30 ng 模板 DNA、 2. 5 mmol· L - 1 Mg2 + 、 0. 20 mmol· L - 1dNTPs、 0. 4 μmol· L - 1上下游引物和 0. 75 U Taq DNA 聚合酶及 1 × PCR buffer。 采用 SRAP 引物组合 pm21 - em8,以 78 个桂花品种的总 DNA 为样品,对优化的 SRAP - PCR 反应体系进行初步验证,共扩增出632 条带,多态性条带百分率 75. 32% ;扩增位点 15 个,多态性位点百分率为 86. 67% 。 运用优化的 SRAP - PCR 体系,使用筛选出的 18对 SRAP 引物组合对 88 个桂花品种、1 个桂花野生种以及 2 个外类群〔柊树 O. heterophyllus (G. Don) P. S. Green和华东木犀 O. cooperi Hemsl.〕的总 DNA 进行扩增,共扩增出 296 个位点,其中多态性位点 248 个,多态性位点百分率为 83. 78% 。 实验结果显示,运用优化的 SRAP - PCR 反应体系获得的 DNA 条带清晰、扩增结果稳定、多态性较丰富;SRAP 分子标记可用于桂花遗传多样性、品种资源鉴定、亲缘关系以及系统进化等方面的研究。 |
Abstract | Single factor experiments on amounts of template DNA and Taq DNA polymerase, |
分类号 | Q523 + . 8; Q946 - 33 |
收稿日期 | 2008-12-08 |
关键词 | 桂花; SRAP - PCR; 扩增体系; 优化; 验证; 遗传多样性 |
Key words | Osmanthus fragrans ( Thunb.) Lour.; SRAP-PCR; amplification system; optimization; verification; genetic diversity |
作者 | 李梅1,2, 侯喜林1, 郝日明3 |
所在单位 | 1. 南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室, 江苏 南京 210095; 2 . 江苏省• 中国科学院植物研究所(南京中山植物园), 江苏 南京 210014; 3. 南京农业大学园艺学院, 江苏 南京 210095 |
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基金项目 | 国家自然科学基金资助项目(30771761) |